W trybie planowym ze strony centralnego układu nerwowego:
- wady rozwojowe OUN (ośrodkowego układu nerwowego),
- zmiany nowotworowe i guzy mózgu, rdzenia kręgowego i kanału kręgowego,
- choroby demielinizacyjne (np. diagnostyka stwardnienia rozsianego – SM),
- diagnostyka zmian niedokrwiennych mózgu i rdzenia kręgowego (udarowych), zwłaszcza we wczesnym okresie (pierwszej doby), kiedy zmiany te nie uwidaczniają się w tomografii komputerowej,
- choroby zwyrodnieniowe i degeneracyjne (np. w choroba Alzheimera),
- schorzenia zapalne OUN: wirusowe, bakteryjne, grzybicze i pasożytnicze,
- anomalie i wady naczyń mózgowych – tętniaki, malformacje naczyniowe – (angio-MR),
- diagnostyka obrazowa przysadki mózgowej,
- obrazowanie oczodołów i struktur wewnątrzoczodołowych.
W trybie planowym ze strony kręgosłupa:
- choroba zwyrodnieniowa,
- urazy,
- nowotwory,
- zakażenia,
- odmiany i wady rozwojowe,
- malformacje naczyniowe,
- zmiany demielinizacyjne, naczyniopochodne rdzenia kręgowego
- patalogie szpiku kostnego.
W trybie planowym ze strony układu mięśniowo-szkieletowego (układ ruchu, stawy):
- zmiany pourazowe, zapalne,
- ocena zaawansowania zmian nowotworowych (stopnia złośliwości guza oraz określenie rozległości nacieku).
W trybie planowym ze strony jamy brzusznej, miednicy:
- weryfikacja niejednoznacznego obrazu w tomografii komputerowej,
- gdy wykonanie badania tomograficznego jest niewskazane, np. alergia na środki kontrastowe lub u pacjentów, którzy otrzymali duże dawki promieniowania jonizującego,
- rozsiane, ogniskowe zmiany w wątrobie i innych narządach miąższowych procesy rozrostowe pierwotne i wtórne,
- nerka po transplantacji,
- kamica dróg żółciowych,
- zmiany ogniskowe nadnerczy,
- guzy jelita grubego (esicy, odbytnicy),
- procesy zapalne i nowotworowe miednicy małej.
W trybie planowym badania naczyniowe z trójwymiarowym opracowaniem obrazu:
- diagnostyka tętniaków oraz malformacji tętniczo żylnych,
- badania przesiewowe w diagnostyce wad naczyń mózgowych.
W trybie planowym sutków (mammografia MR):
- badanie z wyboru w screeningu pacjentek nosicielek genu BRCA1, BRCA2,
- badanie przedoperacyjne dla wykluczenia wieloogniskowego procesu nowotworowego,
- przerzut bez ogniska pierwotnego,
- różnicowanie pomiędzy blizną popromienną a rakiem,
- ocena po operacjach oszczędzających,
- ocena po wszczepianiu implantów.